MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 39296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017515	TATCCA	2	12	15	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850284
2	NC_017515	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385850284
3	NC_017515	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385850284
4	NC_017515	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850284
5	NC_017515	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850284
6	NC_017515	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385850284
7	NC_017515	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850284
8	NC_017515	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385850284
9	NC_017515	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850285
10	NC_017515	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850285
11	NC_017515	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385850285
12	NC_017515	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385850285
13	NC_017515	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385850285
14	NC_017515	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850286
15	NC_017515	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850286
16	NC_017515	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850286
17	NC_017515	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850286
18	NC_017515	GTTT	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	385850286
19	NC_017515	TCG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850286
20	NC_017515	GT	3	6	1226	1231	0 %	50 %	50 %	0 %	385850286
21	NC_017515	TTC	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850286
22	NC_017515	TGGAGA	2	12	1410	1421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385850286
23	NC_017515	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385850286
24	NC_017515	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850286
25	NC_017515	TCG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850286
26	NC_017515	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385850286
27	NC_017515	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850286
28	NC_017515	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385850286
29	NC_017515	ATC	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850286
30	NC_017515	CAGG	2	8	1631	1638	25 %	0 %	50 %	25 %	385850286
31	NC_017515	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850286
32	NC_017515	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850286
33	NC_017515	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850286
34	NC_017515	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850286
35	NC_017515	GTCC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	25 %	50 %	385850286
36	NC_017515	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850286
37	NC_017515	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850286
38	NC_017515	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850286
39	NC_017515	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850286
40	NC_017515	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850286
41	NC_017515	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850286
42	NC_017515	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850286
43	NC_017515	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850286
44	NC_017515	CGG	2	6	2074	2079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850286
45	NC_017515	ACG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850286
46	NC_017515	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850286
47	NC_017515	GC	3	6	2169	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	385850286
48	NC_017515	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850286
49	NC_017515	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850286
50	NC_017515	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850286
51	NC_017515	GCA	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850287
52	NC_017515	T	7	7	2514	2520	0 %	100 %	0 %	0 %	385850287
53	NC_017515	TCC	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385850287
54	NC_017515	CCG	2	6	2595	2600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850287
55	NC_017515	CAC	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385850287
56	NC_017515	CGGA	2	8	2665	2672	25 %	0 %	50 %	25 %	385850287
57	NC_017515	TGT	2	6	2673	2678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850287
58	NC_017515	GC	3	6	2725	2730	0 %	0 %	50 %	50 %	385850287
59	NC_017515	CCG	2	6	2755	2760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850287
60	NC_017515	T	6	6	2788	2793	0 %	100 %	0 %	0 %	385850287
61	NC_017515	CGG	2	6	2901	2906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850287
62	NC_017515	CGG	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850287
63	NC_017515	GCCC	2	8	2955	2962	0 %	0 %	25 %	75 %	385850287
64	NC_017515	GCC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850288
65	NC_017515	GAT	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850288
66	NC_017515	GCA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850288
67	NC_017515	ATC	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850288
68	NC_017515	CAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850288
69	NC_017515	CG	3	6	3263	3268	0 %	0 %	50 %	50 %	385850288
70	NC_017515	TTG	2	6	3286	3291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850288
71	NC_017515	GCG	2	6	3320	3325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850288
72	NC_017515	GCA	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850288
73	NC_017515	TTC	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850288
74	NC_017515	GGC	2	6	3381	3386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850288
75	NC_017515	TGC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850288
76	NC_017515	GACAT	2	10	3430	3439	40 %	20 %	20 %	20 %	385850288
77	NC_017515	GCC	2	6	3591	3596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850289
78	NC_017515	ACA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850289
79	NC_017515	TGCC	2	8	3736	3743	0 %	25 %	25 %	50 %	385850289
80	NC_017515	A	6	6	3768	3773	100 %	0 %	0 %	0 %	385850289
81	NC_017515	CAAA	2	8	3833	3840	75 %	0 %	0 %	25 %	385850289
82	NC_017515	CGT	2	6	3935	3940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850289
83	NC_017515	A	6	6	3991	3996	100 %	0 %	0 %	0 %	385850289
84	NC_017515	CGG	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850290
85	NC_017515	CAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850290
86	NC_017515	GAT	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850290
87	NC_017515	CCG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850290
88	NC_017515	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850290
89	NC_017515	CGG	2	6	4651	4656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850290
90	NC_017515	AAC	3	9	4659	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850290
91	NC_017515	CGT	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850290
92	NC_017515	CCAGC	2	10	4696	4705	20 %	0 %	20 %	60 %	385850290
93	NC_017515	CTG	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850290
94	NC_017515	CGA	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850290
95	NC_017515	AAC	2	6	4795	4800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850290
96	NC_017515	TCG	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850290
97	NC_017515	GAC	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850290
98	NC_017515	CAT	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850291
99	NC_017515	CG	3	6	4920	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	385850291
100	NC_017515	CGC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850291
101	NC_017515	CCG	3	9	5093	5101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850291
102	NC_017515	CTG	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850291
103	NC_017515	CG	3	6	5138	5143	0 %	0 %	50 %	50 %	385850291
104	NC_017515	ACA	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850291
105	NC_017515	AGA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850291
106	NC_017515	GAA	2	6	5191	5196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850291
107	NC_017515	TTTC	2	8	5416	5423	0 %	75 %	0 %	25 %	385850291
108	NC_017515	AGA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850291
109	NC_017515	GC	3	6	5522	5527	0 %	0 %	50 %	50 %	385850291
110	NC_017515	CGT	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850291
111	NC_017515	CCG	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850291
112	NC_017515	CCG	3	9	5585	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850291
113	NC_017515	GCT	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850291
114	NC_017515	CT	3	6	5620	5625	0 %	50 %	0 %	50 %	385850291
115	NC_017515	TCT	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850291
116	NC_017515	CCA	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385850291
117	NC_017515	A	6	6	5791	5796	100 %	0 %	0 %	0 %	385850291
118	NC_017515	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	385850292
119	NC_017515	TCA	2	6	5993	5998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850292
120	NC_017515	AAGGC	2	10	6006	6015	40 %	0 %	40 %	20 %	385850292
121	NC_017515	CG	3	6	6022	6027	0 %	0 %	50 %	50 %	385850292
122	NC_017515	GCAC	2	8	6079	6086	25 %	0 %	25 %	50 %	385850292
123	NC_017515	GCC	2	6	6101	6106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850292
124	NC_017515	CGG	2	6	6111	6116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850292
125	NC_017515	CGC	2	6	6209	6214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850293
126	NC_017515	GGCA	2	8	6234	6241	25 %	0 %	50 %	25 %	385850293
127	NC_017515	CGC	3	9	6272	6280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850293
128	NC_017515	CGC	2	6	6327	6332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850293
129	NC_017515	CGC	3	9	6341	6349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850293
130	NC_017515	GCTTT	2	10	6364	6373	0 %	60 %	20 %	20 %	385850293
131	NC_017515	TCAAAC	2	12	6418	6429	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385850293
132	NC_017515	CGG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850293
133	NC_017515	GCG	2	6	6487	6492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850293
134	NC_017515	ATC	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850293
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136	NC_017515	TCA	2	6	6565	6570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850293
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255	NC_017515	GAT	2	6	12263	12268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850298
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263	NC_017515	GC	3	6	12918	12923	0 %	0 %	50 %	50 %	385850298
264	NC_017515	CCCG	2	8	12929	12936	0 %	0 %	25 %	75 %	385850298
265	NC_017515	CG	3	6	12957	12962	0 %	0 %	50 %	50 %	385850298
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271	NC_017515	GCC	2	6	13058	13063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850298
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382	NC_017515	CAGTTT	2	12	23391	23402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385850307
383	NC_017515	GGC	2	6	23415	23420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850307
384	NC_017515	TTC	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850307
385	NC_017515	GAT	2	6	23547	23552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850307
386	NC_017515	TGC	2	6	23597	23602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850307
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388	NC_017515	TTTG	2	8	23732	23739	0 %	75 %	25 %	0 %	385850307
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